ในภาพยนตร์แอนิเมชันที่ถ่ายทอดเรื่องราวความรักข้ามจักรวาล ห้วงอวกาศอันกว้างใหญ่ไร้ขอบเขตกลายเป็นอุปสรรคขวางกั้นนักบินอวกาศสาวและคนรัก เมื่อเธอออกเดินทางสู่ดาวอังคาร

เมื่อคู่สามีภรรยาที่ห่างเหินถูกตั้งค่าหัว ทั้งสองต้องหนีการไล่ล่าจากอดีตเจ้านายไปพร้อมกับลูกชายของพวกเขา โดยมีหน่วยปฏิบัติการลับถูกส่งมาเพื่อสังหารพวกเขา

หน่วยรบพิเศษของกองทัพเรือสหรัฐหมวดหนึ่ง ได้เข้าไปปฏิบัติภารกิจอันตรายในเมืองรามาดี ประเทศอิรัก และเรื่องราวของความโกลาหลและภราดรภาพแห่งสงคราม ก็ถูกบอกเล่าผ่านทางความทรงจำของพวกเขาที่มีต่อเหตุการณ์ดังกล่าว

หนึ่งปีหลังจากที่ เมลานี พี่สาวของเธอหายตัวไปอย่างลึกลับ โคลเวอร์ และเพื่อน ๆ ได้เดินทางไปยังหุบเขาอันห่างไกลที่เธอหายตัวไปเพื่อค้นหาคำตอบ ขณะที่พวกเขาสำรวจศูนย์บริการนักท่องเที่ยวที่ถูกทิ้งร้าง พวกเขากลับถูกตามล่าโดยฆาตกรสวมหน้ากากและถูกสังหารอย่างโหดเหี้ยมทีละคน… แต่แล้วพวกเขาก็ลืมตาขึ้นมาและพบว่าตัวเองกลับมายังจุดเริ่มต้นของคำ่คืนเดิมอีกครั้ง

สองสามีภรรยาได้เดินทางออกไปฉลองวันเกิดของลูกชายด้วยการล่องเรือในมหาสมุทร จนกระทั่งเกิดพายุรุนแรงพัดเข้าใส่เรือ และเหล่าสิ่งมีชีวิตสุดหิวกระหายจากใต้ทะเลลึกที่เป็นอีกภัยอันตรายหนึ่งมาพร้อมกับพายุโหมกระหน่ำ ทำให้ครอบครัวนี้ต้องร่วมมือกันเพื่อเอาชีวิตรอดออกไปให้ได้

หลังจากพยายามทำใจรับการสูญเสียครั้งใหญ่ ราชาที่กำลังเศร้าโศกก็ค้นพบเป้าหมายใหม่ นั่นคือการทำสงครามกับศัตรูผู้ทรงอำนาจ เพื่อปกป้องปวงชนผู้ยากไร้

หลังจากเอาตัวรอดจากเหตุการณ์อุบัติเหตุบนรถไฟครั้งใหญ่ อีธาน ก็ได้รู้ว่า เดอะ เอนทิตี้ ถูกเก็บเอาไว้บนเรือดำนํ้าเก่าของรัสเซีย แต่ศัตรูจากอดีตของเขาที่มีชื่อว่า เกเบรียล ก็ตามรอยมันอยู่ด้วยเช่นกัน

อีธาน ฮันท์ และทีมจะต้องออกไปเผชิญหน้ากับภารกิจที่อันตรายกว่าที่เคยผ่านมา โดยพวกเขาและเธอต้องติดตามอาวุธชิ้นใหม่ที่จะกลายมาเป็นอันตรายกับมนุษยชาติ และด้วยชะตาของโลกที่แขวนอยู่บนเส้นด้าย อีธาน และทีมของเขาจะต้องออกเดินทางไปทั่วโลก และในระหว่างภารกิจ อีธาน ก็จะได้เรียนรู้ว่าไม่มีอะไรสำคัญไปกว่าภารกิจของเขา แม้ว่าสิ่งเหล่านั้นจะเป็นชีวิตของคนที่เขารักก็ตาม

เมื่อภารกิจไม่เป็นไปตามแผนที่วางไว้ อีธาน ฮันท์และทีมของเขาจึงต้องร่วมมือกับซีไอเอและเพื่อนหน้าเก่าๆ เพื่อปกป้องโลกจากการทำลายล้างของระเบิดนิวเคลียร์

เมื่อองค์กรไอเอ็มเอฟปิดตัวลง สายลับอีธาน ฮันท์และพันธมิตรจึงประกาศสงครามกับ ซินดิเคท กลุ่มสายลับที่ทรยศต่อองค์กรและวางแผนที่จะทำลายล้างโลก